Dihedral Angle
Une version simplifiée de l'équation de Karplus originale est utilisée pour calculer très rapidement l'angle / de torsion dièdre (en degrés) à partir d'un proton / 3J du spectre RMN 1H (vicinal H-C-C-H) constante de couplage (Hz) et vice-versa. Le calcul est basé sur des documents publiés; voir le dialogue info (i) pour les détails des équations et des références. Les calculs fonctionnent le mieux pour les systèmes bicycliques rigides, se rapprochant le plus d'un degré ou mieux par rapport à l'équation H-C-C-H Karplus d'origine. L'utilisateur peut choisir entre une plage d'angle probable entre 0-90 degrés ou 90-180 degrés pour une utilisation comme entrée ou sortie. A titre d'alternative à l'utilisation de deux équations, et une variation de l'équation Karplus, l'équation Bothner-A est utilisé pour calculer 3J H-C-C-H dièdres. Enfin, l'utilisateur peut entrer ses propres paramètres empiriques dérivés (en particulier ayant trait à électronégativité et d'autres données) et la constante de couplage ou d'angle destiné à être utilisé dans des modifications de l'équation Karplus pour déterminer fréquemment les constantes de couplage et étendu à l'inclusion des atomes autres que l'hydrogène (C
- 13, N-15, etc.). Ceci peut être utilisé pour des acides aminés ou une analyse de protéine calculs. Il vous permettra également de nier ces valeurs d'entrée et de sauvegarder l'angle d'entrée, les constantes (coefficients) A, B et C, la sortie J et nom (en option) à un fichier (dihedral.txt), avec une notification, dans votre intérieur par défaut stockage (sdcard) dièdres dossier, que vous pouvez transférer (copier-coller) sur un support externe avec un programme comme commandant du fichier. Il y a la possibilité d'arrondir la constante de couplage calculé à partir de ce calcul.Soyez conscient que, pour un motif quartet de fractionnement, à titre d'exemple (modèle de AX3, par exemple vicinal méthyl protons) la moyenne J est d'environ 7 Hz et le calcul ne donne pas leurs angles dièdres individuels tels qu'ils existent dans différentes conformations par rapport au proton ( s) ils sont couplés à.support graphique (G) a été ajouté à la version 2, de sorte qu'une ligne graphique attrayante (0-180 degrés) est produit à l'écran pour une équation de Karplus modifiée à l'aide de vos constantes déterminées A, B et C et est scrollable pour voir le complet gamme. La résolution peut également être augmentée en utilisant plusieurs points sur le graphe par un facteur de cinq. Votre appareil ou applications 3ème partie peuvent être utilisés pour la capture d'écran pour enregistrer le graphique pour votre appareil.Soutien à l'utilisation de l'équation Haasnoot-Altona a été ajouté à la version 3 pour étudier les effets des substituants électronégatifs. Ceci est destiné aux utilisateurs plus avancés, familiers avec ces équations et des paramètres en choisissant un angle dièdre susceptible de calculer la constante de couplage 3J et les données peuvent être sauvegardées.Cette application ne nécessite aucune connexion réseau pour effectuer les calculs; le réglage de la taille de la police peut être réalisée à partir de paramètres de votre appareil et l'App (pour faire les calculs) est défilante.En cliquant sur l'angle dièdre ou couplage constant donne le résultat au-dessus. Accueil (le bouton central au bas de l'écran) quitte l'application et Back (le bouton gauche) donne des résultats précédents. Les données en entrée hors gamme répond avec NaN. Meilleur support pour erreur de l'utilisateur a été ajouté et une sortie plus réaliste à 4 D.P. dans la plupart des calculs sur l'activité de l'écran principal.L'accès au réseau requis uniquement pour les annonces en direct.Feedback encouragé les mises à jour futures!
- 13, N-15, etc.). Ceci peut être utilisé pour des acides aminés ou une analyse de protéine calculs. Il vous permettra également de nier ces valeurs d'entrée et de sauvegarder l'angle d'entrée, les constantes (coefficients) A, B et C, la sortie J et nom (en option) à un fichier (dihedral.txt), avec une notification, dans votre intérieur par défaut stockage (sdcard) dièdres dossier, que vous pouvez transférer (copier-coller) sur un support externe avec un programme comme commandant du fichier. Il y a la possibilité d'arrondir la constante de couplage calculé à partir de ce calcul.Soyez conscient que, pour un motif quartet de fractionnement, à titre d'exemple (modèle de AX3, par exemple vicinal méthyl protons) la moyenne J est d'environ 7 Hz et le calcul ne donne pas leurs angles dièdres individuels tels qu'ils existent dans différentes conformations par rapport au proton ( s) ils sont couplés à.support graphique (G) a été ajouté à la version 2, de sorte qu'une ligne graphique attrayante (0-180 degrés) est produit à l'écran pour une équation de Karplus modifiée à l'aide de vos constantes déterminées A, B et C et est scrollable pour voir le complet gamme. La résolution peut également être augmentée en utilisant plusieurs points sur le graphe par un facteur de cinq. Votre appareil ou applications 3ème partie peuvent être utilisés pour la capture d'écran pour enregistrer le graphique pour votre appareil.Soutien à l'utilisation de l'équation Haasnoot-Altona a été ajouté à la version 3 pour étudier les effets des substituants électronégatifs. Ceci est destiné aux utilisateurs plus avancés, familiers avec ces équations et des paramètres en choisissant un angle dièdre susceptible de calculer la constante de couplage 3J et les données peuvent être sauvegardées.Cette application ne nécessite aucune connexion réseau pour effectuer les calculs; le réglage de la taille de la police peut être réalisée à partir de paramètres de votre appareil et l'App (pour faire les calculs) est défilante.En cliquant sur l'angle dièdre ou couplage constant donne le résultat au-dessus. Accueil (le bouton central au bas de l'écran) quitte l'application et Back (le bouton gauche) donne des résultats précédents. Les données en entrée hors gamme répond avec NaN. Meilleur support pour erreur de l'utilisateur a été ajouté et une sortie plus réaliste à 4 D.P. dans la plupart des calculs sur l'activité de l'écran principal.L'accès au réseau requis uniquement pour les annonces en direct.Feedback encouragé les mises à jour futures!
Catégorie : Éducation
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